深圳市万泽微生物研究有限公司龙俊儒获国家专利权
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龙图腾网获悉深圳市万泽微生物研究有限公司申请的专利一种基于结构域特征的微生物培养温度预测方法与系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN121303388B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-04-24发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202511865098.1,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权一种基于结构域特征的微生物培养温度预测方法与系统是由龙俊儒;黄强;陈章然;周欢;刘彦民;李康宁;蒋鲁杰;林雄;黄少磊设计研发完成,并于2025-12-11向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于结构域特征的微生物培养温度预测方法与系统在说明书摘要公布了:本发明属于微生物培养方法技术领域,具体涉及一种基于结构域特征的微生物培养温度预测方法与系统,通过对蛋白质序列进行比对提取结构域信息并根据预设组合规则形成生物学特征矩阵,基于生物学特征矩阵通过机器学习模型实现温度区间的划分及培养温度的预测。本发明通过组合规则,识别特定功能模块与多个关键结构域的特征,提高特征的生物学真实性与预测效果,从而构建的生物学特征矩阵具备较高的生物可解释性。同时通过机器学习模型实现温度区间的划分及培养温度的预测,对温度边界样本误差显著降低,支持更大温度范围预测,实现边界样本平滑预测,显著降低错分带来的误差。
本发明授权一种基于结构域特征的微生物培养温度预测方法与系统在权利要求书中公布了:1.一种基于结构域特征的微生物培养温度预测方法,其特征在于,包括以下方法步骤,获取带有培养温度的微生物信息,获取微生物对应的蛋白质序列;对所述蛋白质序列进行相关结构域比对,提取与温度适应相关基因的对应的蛋白质序列的结构域信息;根据预设组合规则,基于所述结构域信息生成生物学特征矩阵;根据蛋白质序列,基于预设组合规则,计算所述预设组合规则中每条规则的得分;所述生物学特征矩阵包括所述预设组合规则的内每条规则的规则分数;所述规则分数为所述预设组合规则中每条规则的得分与对应的方向权重的乘积;所述方向权重基于对应规则与微生物培养温度关系获得;将微生物划分为包括低温微生物、中温微生物和高温微生物的多种温度区间的微生物;所述低温微生物为温度区间小于20℃的微生物,所述中温微生物为温度区间为20–50℃的微生物,所述高温微生物为温度区间大于50℃的微生物;基于所述生物学特征矩阵,针对每个所述温度区间的微生物,训练机器学习模型;获取待预测微生物的蛋白质序列,基于蛋白质序列提取结构域信息,基于所述结构域信息生成生物学特征矩阵,将生物学特征矩阵输入所述机器学习模型,预测微生物的培养温度; 所述预设组合规则包括全命中规则、任意命中规则和三域命中规则;在所述全命中规则中,当规则内的所有结构域都命中时,得分为所有结构域的匹配置信度之和,否则得分为零;所述全命中规则包括GroEL和GroES的双亚基伴侣系统;在所述任意命中规则中,当规则内至少一个结构域被命中时,得分为被命中的结构域中对应的最高匹配置信度,否则得分为零;所述任意命中规则包括HtpG和RNaseR的单域标志基因;在所述三域命中规则中,当规则内的三个结构域都被命中时,得分为三个结构域的匹配置信度之和,当规则内的三个结构域被命中两个时得分为命中的两个结构域的匹配置信度之和与预设倍率的乘积,否则得分为零;所述三域命中规则包括dnaK、dnaJ和grpE的三元折叠伴侣。
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