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  • 本发明提出了一种基于图神经网络与对比学习的单细胞水平动态基因调控网络推断方法,旨在解决现有单组学方法因无法刻画细胞异质性,而难以揭示单细胞分辨率下基因调控关系动态变化的问题。该方法包括以下步骤:首先,分别通过对比学习与图表示学习预训练生成细...
  • 本发明涉及一种细胞命运决定因子识别方法及相关装置,属于生物信息学技术领域,其中,该细胞命运决定因子识别方法包括:确定单细胞转录组测序数据中转录因子和目标基因在细胞内的表达量,并构建细胞谱系;基于细胞谱系中各细胞簇中各转录因子在细胞内的表达量...
  • 本发明涉及人工智能和生物信息学交叉技术领域,尤其涉及适配蛋白质语言模型的多模态酶动力学参数预测方法。其主要针对现有处理方法对酶促反应动态机制建模缺失及三维结构利用不足的问题,提出如下技术方案:步骤一、多模态数据获取与预处理;步骤二、蛋白质语...
  • 本发明提出一种单细胞与空间转录组数据整合的多组学分析系统,涉及生物信息学与计算生物学技术领域,包括输入处理模块、数据整合对齐模块、联合分析模块和可视化输出模块;本发明通过引入双重特征锚定策略,结合差异表达基因与保守的基因共变关系,构建了生物...
  • 本发明公开了一种基于单细胞转录组多维特征的良恶性细胞精准鉴定方法,属于生物信息学、肿瘤分子生物学和细胞鉴定技术领域。以肿瘤组织及癌旁组织的单细胞转录组测序数据为基础,综合拷贝数变异、等位基因特异拷贝数变异及肿瘤相关转录特征三类信息,通过多证...
  • 本发明提供了一种基于多组学分析和机器学习的奶牛酮病调控基因预测系统,属于分子育种与疾病防控技术领域,该系统包括:数据采集与预处理模块、特征集建立模块、机器学习模型建立模块、结果评估模块,整合奶牛基因组、转录组及代谢组数据,经全基因组关联分析...
  • 本发明公开了一种基于机器学习的环境样品中细菌抗生素耐药风险评估方法,适用于空气、水体及土壤等环境多介质。包括:1)识别和定量环境样品中高风险性细菌抗生素耐药基因;2)利用机器学习模型与SHAP可解释性分析鉴别高风险性耐药基因的关键环境影响因...
  • 本发明公开了菌株特异性培养基预测方法、介质及计算机设备,其中方法包括:获取菌株基因功能注释数据并编码为高维特征向量;对高维特征向量进行主成分分析降维;获取候选培养基成分信息并编码为二进制向量;拼接低维菌株特征表示与培养基成分向量以形成联合输...
  • 本发明属于蛋白质荧光强度预测领域,具体涉及一种蛋白质序列荧光强度预测方法、系统、设备及存储介质,方法包括:将训练数据集进行特征提取后,结合随机噪声,对生成器和判别器进行训练,得到生成对抗模型,通过生成对抗模型补充数据,得到预测数据集,然后提...
  • 本发明公开了一种基于配对学习框架的抗菌肽长度自适应生成方法和装置,属于计算生物领域。方法包括:构建引线集、目标集及映射表,引线集包含若干氨基酸序列,目标集包含已知的抗菌肽序列;映射表用于显式定义引线集与目标集的配对关系及长度约束规则;基于引...
  • 本发明涉及基于三维荧光光谱与自动机器学习的地下水氮代谢功能预测及调控方法,包括下列步骤:收集文献中的地下水微生物基因测序序列号以及对应水样的荧光发射光谱数据;根据所获取的基因测序数据序列号,下载微生物基因测序数据,对所需发射光谱数据进行归一...
  • 本发明公开了单细胞RNA测序数据隐私保护的联邦学习分类系统及其方法,涉及数据隐私分类技术领域;对scRNA‑seq数据标准化并通过对比学习和自编码器增强特征;多模型动态协同训练模块,支持图卷积网络、跨模态Transformer等模型根据数据...
  • 本发明公开了一种基于双解码编码器与邻域对比的空间转录组域识别方法,包括如下步骤:步骤一:空间转录组数据预处理;步骤二:空间邻接图构建;步骤三:基于图注意力的编码器特征学习;步骤四:双解码器联合重构;步骤五:邻域感知对比学习;步骤六:联合损失...
  • 本申请公开了一种空间蛋白质表达图谱的重建方法、重建装置及存储介质。包括接收基于组织切片得到的组织区域的多通道高分辨率组织图像;接收对第一和第二组织切片进行的第一、第二方向组织条带切割后而获取的各个目标蛋白质在各个第一、第二方向组织条带上表达...
  • 本公开提供了一种基因测序系统的异常数据定位方法、计算机设备及计算机可读存储介质,其中,该方法包括:获取利用基因测序系统对一个或多个样本的样本文库进行测序得到的基因测序数据,基因测序数据包括样本文库的基因片段序列、基因片段序列所在的成像单元信...
  • 本发明公开一种刻蚀气体的筛选方法、装置及设备,涉及微电子制造刻蚀技术领域,以解决现有技术中筛选刻蚀气体时效率低及成本高的问题。方法包括:构建多个初始氟饱和团簇模型;首先对多个初始氟饱和团簇模型进行团簇模型预筛选,得到多个目标氟饱和团簇模型及...
  • 本发明公开了一种用于金属‑碳蜂窝结构抗冲击行为的分子动力学模拟方法,涉及物理仿真技术领域,包括步骤:构建复合结构原子模型与冲击弹丸刚体模型;对复合结构进行能量最小化与结构弛豫,获得稳定初始构型;将该构型沿结构面面内方向划分为固定约束区、温度...
  • 本发明公开了一种元素偏聚的晶界模型构建方法,涉及金属材料微观结构分析技术领域,其技术方案要点是:该方法首先计算晶界内能,用于区分晶界效应与材料本身的化学差异,再遍历晶界模型中所有原子对原子进行替换,随后计算溶质原子偏聚能,最后构建偏聚构型模...
  • 本发明涉及环境工程技术领域,且公开了一种基于Aspen Plus的土壤修复模拟方法及系统,将石油污染土壤加入管式炉,在氮气气氛下进行热脱附修复与资源回收实验,反应后收集气液固产物;采用Aspen Plus对PCS热脱附修复与资源回收工艺建立...
  • 本申请公开了一种基于周期性形变的线性聚合物熔体缠结密度调控方法,涉及分子动力学模拟技术领域,该方法在恒温恒压条件下沿单一方向对拓扑稳态下的平衡熔体模型施加周期性的拉伸压缩形变循环,通过链间相对滑移改变拓扑交叉点位置,实现缠结网络的可控重排;...
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